Estudo contesta precisão dos testes genéticos para indicar predisposição a doenças
O estudo do genoma com o objetivo de identificar predisposição a doenças como diabete e hipertensão ainda não está avançado o suficiente para garantir exames precisos, indica pesquisa publicada este mês na revista Public Library of Science Genetics. Segundo pesquisadores das universidades americanas de Pittsburgh e da Califórnia, as informações levantadas pelos estudos genômicos de associação – que analisam marcadores genéticos para apontar predisposição a doenças – por enquanto são mais relevantes para entender a biologia das enfermidades do que para prever o risco individual de desenvolvê-las. Matéria de Karina Toledo, da Agência Estado, com informações complementares do EcoDebate.
Eles analisaram a validade clínica de testes para diabete tipo 2, câncer de próstata, problemas cardíacos, degeneração macular relacionada à idade e doença de Crohn. Concluíram que os resultados não aumentaram a capacidade de predição das doenças se comparado à análise de fatores de risco tradicionais. Para o presidente da Sociedade Brasileira de Genética Médica, Salmo Raskin, “esse tipo de teste será fantástico daqui a uns dez anos”.
“Até lá, a gente deve conhecer todos os genes envolvidos nessas doenças complexas e saber qual é o peso da genética e o do ambiente para sua manifestação.” No Brasil ainda não há regulamentação sobre o uso desse tipo de exame, mas o Conselho de Medicina considera antiética sua comercialização. No início deste mês, uma rede brasileira de clínicas, que oferece comercialmente esse tipo de serviço, teve uma filial interditada pelo Conselho Regional de Medicina do Rio Grande do Sul (Cremers) e pela Vigilância Sanitária.
Segundo o presidente do Conselho Regional de Medicina de São Paulo, Henrique Gonçalves, a comercialização de testes preditivos genéticos é uma prática antiética. “O conselho é extremamente favorável à pesquisa. Mas é preciso fazer projeto, pedir aprovação de um conselho de ética e fazer a pesquisa sem que a pessoa tenha de pagar”, diz. “Quando você pega um produto que não tem comprovação científica e entra no mercado, está fazendo pesquisa em humanos sem aprovação, está enganando o paciente que paga pelo serviço.”
* Matéria da Agência Estado, no UOL Notícias, Ciência e Saúde, 16/02/2009 – 13h00
Nota do EcoDebate: a pesquisa “A Systematic Approach to Mapping Recessive Disease Genes in Individuals from Outbred Populations“, publicado pela Plos Genetics está disponível para acesso integral, no formato HTML. Para acessar o artigo clique aqui.
Abaixo, para maiores informações, publicamos o abstract:
Abstract
The identification of recessive disease-causing genes by homozygosity mapping is often restricted by lack of suitable consanguineous families. To overcome these limitations, we apply homozygosity mapping to single affected individuals from outbred populations. In 72 individuals of 54 kindred ascertained worldwide with known homozygous mutations in 13 different recessive disease genes, we performed total genome homozygosity mapping using 250,000 SNP arrays. Likelihood ratio Z-scores (ZLR) were plotted across the genome to detect ZLR peaks that reflect segments of homozygosity by descent, which may harbor the mutated gene. In 93% of cases, the causative gene was positioned within a consistent ZLR peak of homozygosity. The number of peaks reflected the degree of inbreeding. We demonstrate that disease-causing homozygous mutations can be detected in single cases from outbred populations within a single ZLR peak of homozygosity as short as 2 Mb, containing an average of only 16 candidate genes. As many specialty clinics have access to cohorts of individuals from outbred populations, and as our approach will result in smaller genetic candidate regions, the new strategy of homozygosity mapping in single outbred individuals will strongly accelerate the discovery of novel recessive disease genes.
Author Summary
Many childhood diseases are caused by single-gene mutations of recessive genes, in which a child has inherited one mutated gene copy from each parent causing disease in the child, but not in the parents who are healthy heterozygous carriers. As the two mutations represent the disease cause, gene mapping helped understand disease mechanisms. “Homozygosity mapping” has been particularly useful. It assumes that the parents are related and that a disease-causing mutation together with a chromosomal segment of identical markers (i.e., homozygous markers) is transmitted to the affected child through the paternal and the maternal line from an ancestor common to both parents. Homozygosity mapping seeks out those homozygous regions to map the disease-causing gene. Homozygosity mapping requires families, in which the parents are knowingly related, and have multiple affected children. To overcome these limitations, we applied homozygosity mapping to single affected individuals from outbred populations. In 72 individuals with known homozygous mutations in 13 different recessive disease genes, we performed homozygosity mapping. In 93% we detected the causative gene in a segment of homozygosity. We demonstrate that disease-causing homozygous mutations can be detected in single cases from outbred populations. This will strongly accelerate the discovery of novel recessive disease genes.
Citation: Hildebrandt F, Heeringa SF, Rüschendorf F, Attanasio M, Nürnberg G, et al. (2009) A Systematic Approach to Mapping Recessive Disease Genes in Individuals from Outbred Populations. PLoS Genet 5(1): e1000353. doi:10.1371/journal.pgen.1000353
Editor: Takashi Gojobori, National Institute of Genetics, Japan
Received: August 13, 2008; Accepted: December 22, 2008; Published: January 23, 2009
Copyright: © 2009 Otto et al. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
Funding: This work was supported by grants to FH from the National Institutes of Health (DK068306, DK064614, DK069274, DK076683, HD045345), and the Thrasher Research Fund. FH is an investigator of the Howard Hughes Medical Institute, a Frederick GL Huetwell Professor, and a Doris Duke Distinguished Clinical Scientist. The work was further supported by the German Federal Ministry of Science and Education through the National Genome Research Network (grant 01GR0416 to PN).
Competing interests: The authors have declared that no competing interests exist.
[EcoDebate, 17/02/2009]
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